长相思第三季讲述了涂山璟和小夭终于解除了误会，神农义军退出历史的舞台，作为神农义军将领的相柳面临最终的抉择。大荒的统一成为大势所趋，轩辕发动了对高辛的战争，面对养育自己的高辛俊帝、最珍视的亲人小夭和阿念，颛顼经历最严峻的考验。俊帝带着小夭前往寻找父母，小夭的母亲阿珩亲自揭开了小夭的身世之谜。小夭和涂山璟两人在一切事情尘埃落地之后终得相守，颛顼孤守帝位，而世间再无相柳。